Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EGFRP00533 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EGFRP00533 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EGFRP00533 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EGFRP00533 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EGFRP00533 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EGFRP00533 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EGFRP00533 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EGFRP00533 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EGFRP00533 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EGFRP00533 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms