Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX6O95503 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX6O95503 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX6O95503 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX6O95503 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CBX6O95503 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX6O95503 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX6O95503 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms