Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM63AO94886 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms