Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGR5O75473 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGR5O75473 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGR5O75473 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGR5O75473 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LGR5O75473 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGR5O75473 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGR5O75473 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR5O75473 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR5O75473 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR5O75473 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR5O75473 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR5O75473 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR5O75473 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGR5O75473 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LGR5O75473 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR5O75473 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR5O75473 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR5O75473 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR5O75473 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR5O75473 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR5O75473 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGR5O75473 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR5O75473 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR5O75473 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGR5O75473 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms