Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF40O75150 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF40O75150 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF40O75150 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF40O75150 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF40O75150 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF40O75150 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF40O75150 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF40O75150 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF40O75150 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF40O75150 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF40O75150 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF40O75150 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF40O75150 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF40O75150 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF40O75150 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF40O75150 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms