Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSCO60682 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSCO60682 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSCO60682 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSCO60682 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSCO60682 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSCO60682 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSCO60682 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSCO60682 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSCO60682 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSCO60682 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSCO60682 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSCO60682 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSCO60682 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSCO60682 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSCO60682 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSCO60682 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms