Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNT1O60563 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNT1O60563 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNT1O60563 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms