Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRNO43815 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRNO43815 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRNO43815 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRNO43815 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRNO43815 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRNO43815 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRNO43815 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRNO43815 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRNO43815 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRNO43815 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRNO43815 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRNO43815 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRNO43815 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRNO43815 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRNO43815 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRNO43815 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRNO43815 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRNO43815 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRNO43815 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRNO43815 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms