Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FOXO3O43524 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOXO3O43524 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO3O43524 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms