Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA3O43365 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA3O43365 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms