Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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