Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8W8V4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8W8V4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8W8V4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8W8V4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8W8V4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8W8V4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8W8V4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8W8V4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8W8V4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F8W8V4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8W8V4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8W8V4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8W8V4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8W8V4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8W8V4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8W8V4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms