Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17654F7AXR3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms