Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf60A6NFR6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf60A6NFR6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms