Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POTEB3A0JP26 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEB3A0JP26 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms