Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIF3AQ9Y496 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIF3AQ9Y496 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms