Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms