Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO1Q9UM00 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO1Q9UM00 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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