Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD1Q9UIS9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD1Q9UIS9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms