Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASIC3Q9UHC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASIC3Q9UHC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASIC3Q9UHC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms