Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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SH3BP4Q9P0V3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP4Q9P0V3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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SH3BP4Q9P0V3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4Q9P0V3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SH3BP4Q9P0V3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SH3BP4Q9P0V3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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SH3BP4Q9P0V3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4Q9P0V3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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