Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM28Q9NW13 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM28Q9NW13 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms