Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMBRD1Q9NUN5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBRD1Q9NUN5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms