Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAMSN1Q9NSI8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMSN1Q9NSI8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms