Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRC4Q9NPP4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRC4Q9NPP4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms