Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpa33Q9JKA5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.5 ms