Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VAT1LQ9HCJ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms