Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDFQ9HBH1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDFQ9HBH1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDFQ9HBH1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms