Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZMYND12Q9H0C1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZMYND12Q9H0C1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms