Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIF3L1Q9GZT8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms