Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfip11Q9ERA6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms