Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelenooQ9DBC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenooQ9DBC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms