Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT23Q9C075 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT23Q9C075 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT23Q9C075 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms