Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPEB1Q9BZB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPEB1Q9BZB8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms