Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A5Q9BY07 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A5Q9BY07 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms