Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
KCNS3Q9BQ31 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNS3Q9BQ31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms