Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBBP8Q99708 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP8Q99708 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP8Q99708 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms