Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRBNQ96SW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRBNQ96SW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms