Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOX2Q96NM4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOX2Q96NM4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms