Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf85Q96MD7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms