Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC17Q96LX7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC17Q96LX7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms