Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM87BQ96K49 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM87BQ96K49 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms