Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1Q96FS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIPA1Q96FS4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms