Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP3Q96FM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms