Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRAT1Q92837 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRAT1Q92837 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms