Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCTD4Q8WVF5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCTD4Q8WVF5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms