Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms