Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK9Q8TD19 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK9Q8TD19 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms