Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms