Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
TTLL11Q8NHH1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTLL11Q8NHH1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms